乔治亚州生物储存库联盟(BRAG-Onc)的使命是为整个乔治亚州的生物标本采购和分发提供集中服务,以推进癌症研究。
BRAG-Onc的建立是为了代表乔治亚州癌症患者群体的多样性,并加强该州的癌症研究。标本库在标准化条件下收集和储存标本,并附带临床和人口统计信息。这些藏品由一个可访问网络的库存管理和注释数据库和一个长期储存设施提供支持,该设施拥有冷冻保存标本的备份。该储存库是全州网络的中央协调中心。
Biorepository
下面将介绍一些有代表性的研究,以证明该联盟在支持基础研究和转化研究方面的有效性。在过去的四年里,生物资源库支持了30多个单独的项目。
除了下面介绍的项目外,生物库还参与了癌症基因组图谱(TGCA)项目。这项非常立即博的任务目前是美国国家癌症研究所(NCI)的旗舰研究项目,涉及NCI内部科学家以及来自全球领先研究中心和大学的外部科学家。2003年,第一次完整的人类基因组测序完成,耗资超过30亿美元。从那以后,测序技术得到了指数级的改进,在短短十年内将所需的成本和时间降到了令人瞩目的水平。2009年,NHGRI和NCI启动了全面的TCGA项目,目标是对来自20种最常见癌症的4000名癌症患者进行深入的分子分析和测序。
自2010年以来,bragg - onc一直是TCGA网络的立即博成员,并提供了多种癌症类型的标本,包括头颈癌、甲状腺癌、卵巢癌和膀胱癌。加入TCGA项目标志着布拉格癌症中心符合最严格的标本处理质量控制标准,与MD安德森、福克斯蔡斯癌症研究所、纪念斯隆-凯特林、伦敦帝国理工学院和加州大学旧金山分校等同行机构一样。
虽然要全面分析产生的大量数据可能需要数年时间,但这一努力的承诺已经开始实现。除了NCI为标本收集和注释提供资金外,GRU癌症中心的医生Weinberger和Bollag最近还在《自然》杂志上发表了一项立即博的TCGA研究。预计还会有更多的出版物和研究者发起的资助提案。
急性髓性白血病
John Cowell博士是乔治亚癌症中心分子肿瘤学和生物标志物项目主任和基础研究副主任。他的实验室在了解白血病干细胞到急性髓性白血病(AML)的进展方面处于领先地位。从生物库中获得的样本有助于了解AML在特定遗传亚型中的分子病因学,并为开发新的治疗方案提供了机会。
人乳腺癌生物标志物的靶向糖蛋白组学鉴定
乔治亚大学癌症中心主任迈克尔·皮尔斯博士也一直在使用生物储存库中的组织来研究聚糖在癌症中的作用。皮尔斯和其他人的研究表明,细胞聚糖的变化可以预示癌细胞或癌前细胞的存在。在他的研究成果中,皮尔斯和他的团队分离出一种被称为Gnt-V的特殊酶,这种酶在结直肠癌和乳腺癌细胞以及其他类型的癌症细胞中升高。该团队目前正在研究抑制Gnt-V的方法,希望开发出一种减缓肿瘤生长和防止转移的治疗方法。
吲哚胺-2,3双加氧酶(IDO)在抑制抗肿瘤免疫反应中的作用
来自肿瘤库的细胞也被儿科教授David Munn博士使用,他研究肿瘤免疫学和免疫抑制和耐受的分子机制。实验室的一个主要焦点是吲哚胺- 2,3双加氧酶(IDO)在色氨酸代谢中的作用。研究了表达IDO的树突状细胞,重点研究了这些细胞如何通过IDO和下游途径抑制抗肿瘤免疫反应。该实验室采用临床和转化策略,旨在利用ido抑制剂药物增强抗肿瘤免疫反应。
热休克蛋白90作为治疗靶点
Chadli实验室的重点是鉴定热休克蛋白90 (Hsp90)抑制剂作为抗癌试剂。Hsp90陪伴机器维持许多致癌蛋白、转录因子、类固醇受体、金属蛋白酶和一氧化氮合酶的构象和稳定性,这些对癌细胞的生存和增殖至关立即博。因此,Hsp90机器是一个令人兴奋的治疗靶点,它的失活将对多种信号通路进行组合攻击,从而更有效地杀死癌细胞并降低对化疗的耐药性。他的实验室开发了一种新型的小分子Hsp90伴随机抑制剂,并使用生物库中的样品来测试这些新药的功效。
淋巴恶性肿瘤的全甲基组测序
Shi实验室花费了大量的精力开发高通量技术,用于解剖正常细胞和癌细胞中复杂的表观遗传调控。他们最近的创新之一是基于基于溶液的序列捕获技术的靶向亚硫酸盐测序方法的开发。目前,他们正在利用这些高通量亚硫酸酯测序方法来分析白血病和淋巴瘤的DNA甲基化模式。他们已经证明,淋巴细胞恶性肿瘤中异常的表观遗传基因调控涉及DNA甲基化、组蛋白修饰和基因组的空间构象。通过生物储存库获得的样本已用于阐明慢性淋巴细胞白血病的表观遗传谱,现在可以区分具有更好结果的亚型。
三阴性乳腺癌的突变分析以检验结果的种族差异
山楂实验室正在对从生物库中获得的三阴性乳腺癌(tnbc)进行测序。三阴性乳腺癌的定义是缺乏可检测的雌激素和孕激素受体表达水平以及缺乏表皮生长因子受体2 (HER2)基因扩增。由于缺乏这些肿瘤特异性分子,目前还没有针对这种类型乳腺癌的靶向治疗方法。患有这种乳腺癌亚型的女性的存活率为14%,而雌激素阳性肿瘤的存活率为97%。非洲裔女性(AA)的乳腺癌发病率普遍低于欧洲裔女性(CA),但CA患者中20%的肿瘤为tnbc,而AA患者中约40%的乳腺癌为tnbc。Hawthorn博士正在使用全基因组测序来分析TNBC肿瘤,并检查CA和AA患者的特征,以确定该疾病在两个种族群体之间是否存在差异。目前关于AA型TNBC作为一种单独疾病实体的数据非常有限,因此获得BRAG-Onc提供的样本对这项立即博研究的成功至关立即博。
烟酸/丁酸受体GPR109A通过抑制细胞存活抑制乳腺肿瘤发生
Drs。乔治亚癌症中心信号和血管生成项目的Ganapathy和Thangaraju研究了烟酸和丁酸盐受体GPR109A的肿瘤抑制功能。这些研究人员利用从brg - onc获得的样本发现,GPR109A在正常乳腺组织中表达,但在肿瘤组织中沉默。研究表明,这种受体的激活会抑制乳腺癌细胞中与细胞存活有关的基因。这些发现已在乳腺癌细胞系和小鼠模型中得到证实,提示GPR109A是乳腺中的肿瘤抑制因子。目前正在进行研究,以确定该基因的治疗性激活是否可能是治疗乳腺癌的有效策略。
这里是目前的医疗中心,诊所等谁是生物储存库联盟的成员格鲁吉亚(布拉格- onc)。